TauDEM

[Александр Мурый]

Voltron, отлично, дружно ждём стабильного релиза

[Voltron]

Кому-то еще (кроме amuriy) TauDEM нужен/интересен? Может, есть на форуме люди, использующие эти инструменты?

[gamm]

Кому-то еще (кроме amuriy) TauDEM нужен/интересен? Может, есть на форуме люди, использующие эти инструменты?

мне

мне вообще все такие инструменты интересны, мы их периодически используем

[Catharsis]

Да, очень интересно

[Voltron]

Disclaimer: я понятия не имеею как работает TauDEM и что должно быть на выходе. Возможно, что-то напутано с параметрами (описание у Дэвида оставляет желать лучшего) или работает не так. Поэтому используем на свой страх и риск. Если у вас пропадут важные данные или сломатся компьютер — я не виноват.

Вобщем, вот.

sextante_taudem.experimental.zip

(13.07 КБ) 439 скачиваний

Еще не все алгоритмы сделаны и не все задумки реализованы, но по идее уже должно работать. Разумеется, сам TauDEM должен быть установлен, а в QGIS кроме этого необходимо установить модуль SEXTANTE. Перед использованием надо зайти в меню «Analysis - SEXTANTE options and configuration» и указать путь к файлам TauDEM

Предложения, пожелания, багрепорты — приветствуются

[Александр Мурый]

Я поставил SEXTANTE в QGIS, разархивировал архивчик в ~/.qgis/python/plugins/sextante. В SEXTANTE Toolbox ничего не изменилось, в настройках «Analysis - SEXTANTE options and configuration» путь к TauDEM прописывать некуда. ЧЯДНТ?

[Voltron]

ЧЯДНТ?

Архивчик надо отдельно разворачивать, в ~/.qgis/python/plugins/sextante_taudem. А потом активировать модуль «TauDEM SEXTANTE provider» в Менеджере модулей

[Александр Мурый]

Voltron, а тебе удалось нормально запустить какую-нибудь утилиту TauDEM? Хотя бы просто из ком. строки..
Я собрал Taudem 5.2 (новую версию), но у меня какая-то лажа с MPI (страшно ругается при запуске любой утилиты). Пробовал и с OpenMPI, и с MPICH2 -- всё то же.

[Voltron]

У меня предыдущая версия, еще со времен начала этой темы, вроде работает. Сейчас собрал 5.2 — особой ругани нет, просто не работает. Пну Дэвида, может, чего подскажет

[Voltron]

Finally!

[Александр Мурый]

Finally!

Круто

Обновил SEXTANTE для QGIS, удалил старую версию TauDEM SEXTANTE Provider, поставил из официальных реп новую версию, прописал пути к исполняемым файлам TauDEM. Пытаюсь сделать самое простое -- "Pit Remove", а кугис ругается про питон:

Код: Выделить всё

Ошибка при выполнении сценария Python:

Traceback (most recent call last):
  File "/home/amuriy/.qgis//python/plugins/sextante/gui/ParametersDialog.py", line 185, in accept
    SextanteLog.addToLog(SextanteLog.LOG_ALGORITHM, command)
  File "/home/amuriy/.qgis//python/plugins/sextante/core/SextanteLog.py", line 36, in addToLog
    line = msgtype + "|" + datetime.datetime.now().strftime("%a %b %d %Y %H:%M:%S") + "|" + text + "\n"
UnicodeDecodeError: 'ascii' codec can't decode byte 0xd0 in position 10: ordinal not in range(128)

Версия Python:
2.6.6 (r266:84292, Dec 27 2010, 00:18:12) 
[GCC 4.4.5]


Версия:
1.8.0-Lisboa Lisboa, exported

Путь поиска Python: ['/home/amuriy/.qgis//python/plugins/sextante_taudem', '/home/amuriy/.qgis//python/plugins/sextante', '/usr/share/qgis/python', '/home/amuriy/.qgis//python', '/home/amuriy/.qgis//python/plugins', '/usr/share/qgis/python/plugins', '/usr/lib/python2.6', '/usr/lib/python2.6/plat-linux2', '/usr/lib/python2.6/lib-tk', '/usr/lib/python2.6/lib-old', '/usr/lib/python2.6/lib-dynload', '/usr/local/lib/python2.6/dist-packages', '/usr/lib/python2.6/dist-packages', '/usr/lib/python2.6/dist-packages/PIL', '/usr/lib/python2.6/dist-packages/gst-0.10', '/usr/lib/pymodules/python2.6', '/usr/lib/pymodules/python2.6/gtk-2.0', '/usr/share/qgis/python/plugins/fTools/tools']

[Voltron]

Какая версия SEXTANTE, локаль? У меня и в Windows, и в Linux работает. Возможно, что SEXTANTE все же староват и часть фиксов связанных с кодировками там отсутствует

[Александр Мурый]

Какая версия SEXTANTE, локаль? У меня и в Windows, и в Linux работает. Возможно, что SEXTANTE все же староват и часть фиксов связанных с кодировками там отсутствует

В QGIS -- SEXTANTE v1.0.7, локаль -- ru_RU.utf8
Кстати, питон не староват -- 2.6.6?

[Voltron]

В QGIS -- SEXTANTE v1.0.7, локаль -- ru_RU.utf8

Так и есть, Виктор не все фиксы в версию 1.0.7 включил. Как костыль можно с LC_ALL=C пускать QGIS либо вытащить SEXTANTE из SVN

Кстати, питон не староват -- 2.6.6?

Не, питон нормальный. У самого такой

[Донецков]

SEXTANTE v1.0.7 установил, TauDEM SEXTANTE установил в ручную, но в модулях он указан как несовместимый?
(QGIS 1.7.4)?