Выяснилось, что у ряда 5×5 фрагментов SRTM из CGIAR неправильно закодировано значение NODATA (спасибо П. Потапову). В нашей версии данных эта ошибка была исправлена.
К сожалению, в GDAL пока нет инструмента для растровой алгебры, поэтому для переназначения использовался скрипт использующий GDAL и Numpy. Медленно, но работает.
Небольшое описание скрипта и страница обсуждения.
