Выпущена новая версия GeoServer. В новой версии актуальная поддержка водяных знаков, обновленная система систем координат, оптимизация генератора KML и ограничение списка проекция отдаваемого по WMS Capabilities. GeoServer продолжает классную модель разработки ПО: само ПО бесплатное, но если вы хотите к нему что-то добавить, очень нужное для вас, то убыстрить процесс можно проспонсировав нужную доработку.
Geoserver и Mapserver используют разные библиотеки: Geotools и Gdal соответсвенно. Но такое впечатление, что у Mapserver’а больше работающих примеров.
Есть некоторая разница, насколько я понимаю, GeoServer построен на Geotools, а вот MapServer отнюдь не на Gdal, он его интенсивно использует для работы с дополнительными растровыми форматами, то он для него просто один из подключаемых модулей.