В текущей версии MapServer (6.1-dev) присутствует баг, в результате которого на низких зум левелах в результате упрощения происходит разрушение полигонов. По плану исправление данной ошибки планируется осуществить в версии 6.2. Пока же для обхода данной проблемы можно воспользоваться недокументированной директивой в разделе описания слоя:
Spatial is now, more than ever, just another column- The Geometry Column.