Если вы такой смелый и столько памяти!(Простите, просто улыбнуло.)
Хотя и не на такой мощной машине, но гораздо более обеспеченной памятью, то же был свидетелем того, что файлы больше 1Гб для большинства ГИС - это просто перекур и чаепитие на весь день.
Кстати, если растр сжат, то в общем размер файла не имеет значения. ОП все равно уйдет больше.
Надеюсь у вас быстрый диск и 64-битная операционная система, т.к. остальным 4Гб все равно не осилить.
Мы свои растры наоборот после получения на несколько частей режем, что бы работать, а не перекуривать.
Если все это вас не отвратило от затеи, то простейший путь виден сразу. Единственно, что он потребует определенного софта. Но речь вроде не шла, что сделать все от начала до конца самому
Шаг 1. Как-то структурировать внутри себя порядок склейки этих файлов.
Шаг 2. Сгенерить в неком программном продукте 6000 World файлов. Поскольку формат ваших файлов не упомянут, то для простоты будем считать, что это World файл к TIF'у, т.е. TWf. Вид текстового World файла:
1
0
0
1
[левый верхний угол_Х]
[левый верхний угол_Y]
Шаг 3. Взять любой мощный софт для обработки геопривязанных растров. Открывать их там порциями, на пример, по-строчно. И склеивать средствами этого софта. Выбор загружаемых файлов то же имеет ограничение, так что надо тут быть осторожнее.
За 3-6 итераций все растры должны склеиться.
PS
Сразу скажу - не знаток оффлайн растровых редакторов, но можно предположить 2 вещи:
1) На форуме есть уважаемые товарищи, которые очень много всего знают. Они могут подсказать продукт, который делает мозаики в оффлайне. Обратитесь с правильным вопросом, может они подскажут.
2) Если это вообще физически возможно, то Фотошоп - это точно делает. Надо только вникнуть в его скриптовый язык программирования. А то что он увеет делать итерационную работу - это точно, сам проверял.
PPS
1) Да, еще надо подумать какой выходной формат. TIF-то может и не потянуть. А векторизатов - точно потянет?
2) Если векторизатор точно тянет такой огромный растр, то подозреваю, он должен уметь не прерываясь переходить на следующий растр.