Это которые "Рабочий стол", "Мои документы" и прочие, куда хомячки любят все подряд сваливать?
Или каталоги по умолчанию? В первом случае нужно копать в сторону системных настроек стандартных диалогов, поскольку MapInfo пользует именно их. Во втором случае Настройки-Режимы-Каталоги