Как правильно сохранять рабочую область и историю?

[Natalia Novoselova]

Знаю, что происходит частое обновление текущей версии, также, как и меняются используемые ОС. Не могу понять - эта ошибка от того, что я делаю неверно (только начала изучать), или же это несостыковка чего-то с чем-то?



Не получается сохранить рабочую область, файл скрипта сохраняется, а рабочая область - нет, хоть, вроде бы, создается файл. Но, когда его открываешь, нет того, что я сделала по срипту. Всё делаю, вроде бы, по описаниям.

[Natalia Novoselova]

Вроде бы по описанию - должно сохранятся. Но действия, выделенные синим - не получаются.
Конечно, можно сохранять только срипт (это получается), но это не удобно может быть потом... всё каждый раз запускать

Но красным - про запуск из каталога, может быть в этом дело? Я не понимаю, что они хотят сказать. Программа установлена в своем директории. Рабочую область мне где надо сохранять, в той папке что-ли? Сейчас я это делаю в другой папке.

Все объекты, созданные в ходе R сессий могут быть сохранены в файл
для использования в последующих R сессиях. В конце каждой сессии R Вам
предоставляется возможность сохранить все имеющиеся в настоящее время
объекты. Если Вы подтвердите, что вы хотите этого, объекты записываются
в файл .RData сноска5 в текущем каталоге, а строки команд, использованных
в сессии сохраняются в файл .Rhistory.

Если R будет запущена позже из этого каталога рабочее пространство
будет перезагружено из этого файла. Одновременно загрузится связанная
история команд.

Мы рекомендуем Вам использовать отдельную рабочую директорию для каждого
из анализов проведенных в R. Очень распространено использовать для
объектов созданых в ходе анализа имена х и у. Имена, подобные этим имеют
смысл в контексте конкретного анализа, но может быть довольно трудно
определить, что они означают, когда несколько анализов были проведены
в одном и том же каталоге.

[Natalia Novoselova]

Новый продукт - новая логика
Кажется, я просто не поняла их принцип сохранения..

[Иван Стрельников]

Больше конкретики когда спрашиваете, пожалуйста.
По сути вопроса, просмотрите команды save() и save.image() для сохранения объектов и history() для сохранения истории. Важно задавать правильные соответствующие расширения для создаваемых файлов.
Сохранение рабочего пространства, мне кажется неудобным. Что если там какой-нибудь емкий процесс был, этак на несколько часов? Не знаю как-кому, но мне удобнее создавать отдельную папку с подпапками для каждого анализа (проекта). Походу работы сохраняю туда отдельные объекты из сессии, там же исходники с данными, сырые графики (обычно в большом количестве), функции и т.д. Параллельно с работой сохраняю команды в текстовом редакторе -- пользуюсь Notepad++. Желательно, но не всегда получается, хорошо комментировать сохраненные последовательности команд. Плюс, небольшие Readme, где вкратце описывается что вообще здесь делалось. Потом легче разобраться.

[Natalia Novoselova]

Больше конкретики когда спрашиваете, пожалуйста.
По сути вопроса, просмотрите команды save() и save.image() для сохранения объектов и history() для сохранения истории. Важно задавать правильные соответствующие расширения для создаваемых файлов.
Сохранение рабочего пространства, мне кажется неудобным. Что если там какой-нибудь емкий процесс был, этак на несколько часов? Не знаю как-кому, но мне удобнее создавать отдельную папку с подпапками для каждого анализа (проекта).

Дело в том, что не могу понять точно принцип сохранения рабочего пространства. Делаю (для тренировки и изучения) разные тесты, строю графики. Потом выхожу: q() - нажимаю "Да" (сохраниться), при этом в рабочем каталоге сохраняется 2 файла: .RData и R.history.
Но если вызывать кликом этот сохранившейся файл - .RData, то в нем нет ничего, созданного в прошлую сессию! Должно ли там это быть?
Но при этом (по нажатии на вертикальную стрелочку) - вызываются все команды прошлой сессии (т.к. сохранилась история).

Итого, мне не понятно, можно ли как-то иначе сохранять рабочую область, чтобы сохранялось, как проект - со всем сделанным (построенные окна графиков, выведенные таблицы и пр)? Или всё это можно сохранять только отдельно (как вы описали ниже)?

[gamm]

Параллельно с работой сохраняю команды в текстовом редакторе -- пользуюсь Notepad++. Желательно, но не всегда получается, хорошо комментировать сохраненные последовательности команд.

это очень плохая практика, характерная для непрограммистов. Нужно все делать наоборот, писать нормальный текст программыв текстовом редакторе, и копипастить его в окно R (TinnR умеет это делать сам, но там с русскими буквами некоторые проблемы). Тогда у вас всегда будет рабочий скрипт, с комментариями, и пр.

[Natalia Novoselova]

Параллельно с работой сохраняю команды в текстовом редакторе -- пользуюсь Notepad++. Желательно, но не всегда получается, хорошо комментировать сохраненные последовательности команд.

это очень плохая практика, характерная для непрограммистов. Нужно все делать наоборот, писать нормальный текст программыв текстовом редакторе, и копипастить его в окно R (TinnR умеет это делать сам, но там с русскими буквами некоторые проблемы). Тогда у вас всегда будет рабочий скрипт, с комментариями, и пр.

А зачем такие сложности с текстовым редактором отдельно? Вроде бы скрипт в R и так хорошо сохраняется (в отличие от того, о чем вопрос выше). Под # - писать комментарии, ниже - текст кода.

[gamm]

в отличие от того, о чем вопрос выше

там тоже все прекрасно сохраняется (и загружается). А зачем редактор использовать, вы поймете. Потом. Если начнете работать.

[Natalia Novoselova]

в отличие от того, о чем вопрос выше

там тоже все прекрасно сохраняется (и загружается).

У меня, почему-то, не получается. Всё же думаю, вряд-ли сохранение рабочей области может давать только запись использованных команд.. Но и напутать нигде не могла - что там путать? Думаю, может быть, с ОС какие-то несостыковки..

Конечно, там и правда можно не сохранять рабочую область, а сохранять только в виде сриптов и уже готовых результатов. Но просто странно.

[Natalia Novoselova]

Если начнете работать.

Да.. теперь, что называется, я слегка так, но уже вполне объемно "прочувствовала" этот язык. Вместе с возможностями самой статистики... Эта вот книга Шипунова - мне в этом и помогла. Более того, эти знания напрямую выходят и на то, с чем уже сталкивалась в ДЗЗ и ГИС софте.

Очень хочется - освоить R (и статистику) хоть в какой-то мере, чтобы уже смогла включать в работу. Потом и по другим проектам смогу это использовать, и так постепенно расширять знания.

[SS_Rebelious]

Потом выхожу: q()

Только командная строка, только хардкор? О_о Зачем же так себя не любить? Вот отличная IDE для R - Rstudio. И никаких notepad'ов не надо...

[Natalia Novoselova]

Потом выхожу: q()

Только командная строка, только хардкор? О_о Зачем же так себя не любить? Вот отличная IDE для R - Rstudio. И никаких notepad'ов не надо...

Спасибо! Не имела представления о таком ресурсе. И на курсе (был небольшой, посвященный R) о таком не говорили. Посмотрю - что это такое.

[Natalia Novoselova]

Дело в том, что не могу понять точно принцип сохранения рабочего пространства. Делаю (для тренировки и изучения) разные тесты, строю графики. Потом выхожу: q() - нажимаю "Да" (сохраниться), при этом в рабочем каталоге сохраняется 2 файла: .RData и R.history.
Но если вызывать кликом этот сохранившейся файл - .RData, то в нем нет ничего, созданного в прошлую сессию! Должно ли там это быть?
Но при этом (по нажатии на вертикальную стрелочку) - вызываются все команды прошлой сессии (т.к. сохранилась история).

Итого, мне не понятно, можно ли как-то иначе сохранять рабочую область, чтобы сохранялось, как проект - со всем сделанным (построенные окна графиков, выведенные таблицы и пр)? Или всё это можно сохранять только отдельно (как вы описали ниже)?

Из описаний в учебниках и ответах в теме - так и не могу понять ответ на этот вопрос. Должно ли вообще сохраняться всё сделанное в рабочей области (файле .Rdata)? Что именно там должно сохраняться?


Хотя бы "Да" или "Нет"? Так я хотя бы пойму - ошибка ли у меня.

[Natalia Novoselova]

Потом выхожу: q()

Только командная строка, только хардкор? О_о Зачем же так себя не любить? Вот отличная IDE для R - Rstudio. И никаких notepad'ов не надо...

Да.. в книге А. Шипунова "Наглядная Статистика. Используем R!" нашла даже широкий обзор разных вариантов пакетов, дающих возможность работать в R с графическим интерфейсом.

R Commander
http://socserv.mcmaster.ca/jfox/Misc/Rcmdr/

RStudio
http://www.rstudio.com/ide/

RKWard
http://www.rstudio.com/ide/

Revolution-R
http://www.revolutionanalytics.com/

JGR(для среды Java)
http://rforge.net/JGR/

Rattle: R Analytical Tool To Learn Easily
http://rattle.togaware.com/

Выбор и здесь - большой... Между тем, думаю, что для новичка важно не распыляться по этому обилию, а аккуратно следовать шаг за шагом, начиная с простого. Иначе - можно утонуть.
Потому - пока с базовым разбираюсь. И буду, видимо, пробовать работать по тем примерам тестов, которые есть в этой же книге Шипунова. Так как - это именно то (по своему содержанию) что мне требуется в моих задачах. Хоть и сложновато понимается сам код и интерпретация в статистике.. но буду пробовать разбираться сразу с конкретными моими данными.